Программы общего назначения должны быть свободными и бесплатными. Ни какое частное лицо или корпорация не должны единолично контролировать миллиарды компьютеров, на которых установлен подобный софт: а это офисные программы, антивирусы, браузеры Интернета, обработка графики, общие программы мультимедиа и пр. самые обычные повседневные программы. Да и сама операционная система... Однако, если говорить о Windows, - она настолько сильно въелась в головы пользователей, настолько сильно с ней повязаны тысячи софтверных фирм - от антивирусных до CAD, от игровых до бухгалтерских, что полностью отказаться от нее невозможно (вернее сложно и затратно, но удачных переходов на полное СПО - полным полно). Поэтому, раз уж пользователь не в состоянии полностью слезть с монополистической проприетарной иглы и избавится от Windows, можно и нужно использовать общесистемные программы СПО на свободных лицензиях GPL, BSD и других, т.е совершенно бесплатные программы. Во-первых, они безопаснее, во-вторых, - не требуют оплаты, и в третьих, - свободное копирование или продажа не только разрешены, но и стимулируются. Кроме того, СПО разрешается модифицировать как угодно: в обязательном доступе исходники к любой программе.

Что касается бесплатных программ по лицензии freeware, но проприетарных, то, опять-таки, все упирается в безопасность и в законность использования. О первом: ни один инженер-программист никогда не даст никакой гарантии, что та или иная бесплатная, но проприетарная программа не содержит себе какой-нибудь "гостинец", только при наличии исходного кода программы можно дать такую гарантию. Ведь, - и это я говорю для обычных пользователей - безопасная программа это не та, на которую не среагировал антивирус - гарантий антивирусные компании не дают никаких, читайте пользовательские соглашения, - а та, о которой точно известно, как она работает, и что делает, особенно если известны все ее не отображаемые действия в системе. Касательно же законности использования - все зависит от пользовательского соглашения, в котором, например, может быть запрещено использование программы в офисах, - вот вам и повод для облавы ОБЭП, вполне законный, если поставили эту программу на работе. А еще бесплатные программы, но проприетарные, грешат навязчивой рекламой и прочими прелестями, достающими пользователя. Не спорю, есть и редкие исключения.

Какие программы следует устанавливать на новую Windows прежде всего?

Если вы приобрели ноутбук или нетбук, или ультрабук с предустановленной Windows, то сначала посмотрите этот материал: Рекламный мусор от производителей ноутбуков: как расшевелить новый компьютер.

В новой свежеустановленной Windows в отличии от свободных дистрибутивов на базе Linux нет практически никаких пользовательских общесистемных программ. Отсутствуют офисные программы, нет серьезных программ для работы с графикой, нет браузера Интернета (а наличесвующий IE - это просто смех), нет кодеков и нет программ для защиты - антивирусов и др. (в Windows 8 наконец-то соизволили включить свой антивирус от Майкрософта, нужно заметить, весьма слабый, что, хоть и косвенно, только подчеркивает техническую несостоятельность этой корпорации: обладая такими гигантскими средствами неспособна сделать серьезный антивирус).

Поэтому, сначала о защите вашего компьютера:

СПО-защита: антивирус и контроль автозапуска

Почему проприетарные антивирусы - это отсутствие безопасности, а не ее наличие? Потому что, во-первых, не известно, что делают эти программы: - их код закрыт и защищен. Во-вторых, понятие вредоносной программы весьма размыто, - что считать вирусом? апплет, который привязывает вас к определенному сайту? или утилиту, которая отсылает данные вашего компьютера? или программу, которая собирает статистику? сотни всевозможных программ делают сомнительные вещи, так какая из них наносит вред, а какая полезна? Кто это определяет? А если некая контора заплатила антивирусной компании за то, чтобы их апплет не считался вирусом? Я уже говорил - гарантий никто не дает, не верите - читайте пользовательские соглашения от любой софтверной компании, в том числе и Майкрософт, - эти даже, наоборот, объявляют, что имеют право собирать информацию о вас и вашем компьютере (известное приложение: Windows Genuine Advantage).

Вот примеры СПО-антивирусов для Windows: связка ClamWin Free Antivirus + Clam Sentinel или Amiti Free Antivirus, эти антивирусные программы используют мощный свободный антивирусный движок ClamAV c ежедневным обновлением баз сигнатур. Также понадобится управление автозапуском программ и служб: Registry Alert и Startup Manager. А также инструмент управления процессами: Process Hacker.

Хочу напомнить, все эти программы следует ставить на чистую, новую Windows.

Если вы все-таки предпочитаете проприетарные решения защиты - здесь список практически всех известных антивирусов, с пометками о наличии бесплатных версий.

Архиваторы, просмоторщики, менеджеры файлов, проигрыватели аудио и|или видео, запись CD|DVD 

Обязательно установите хороший архиватор: чистая новая Windows понимает только zip. В этом нам помогут совершенные во всех смыслах бесплатные и свободные архиваторы 7-zip или  PeaZip, которые работают со всеми известными форматами архивов.

Просмотр файлов формата PDF: Sumatra PDF. Просмотр DjVu: WinDjView.

Просмотр изображений: nomacs Image Lounge.

Файловый менеджер: FAR Manager, Double Commander или muCommander.

Проигрыватели аудио (mp3): например, aTunes, qmmp или CoolPlayer. Проигрыватели видео: VLC media player или Media Player Classic - Home Cinema.

И, наконец, запись CD|DVD: cdrtfe или InfraRecorder.

Замечу, это программы, которые я использую сам. Выбор огромен: все зависит от вкуса.

Программы для работы с Интернетом

Веб-браузеры: Firefox, Chromium, SRWare Iron. Можно и Chrome, он делается на базе Chromium, скачать его можно тут. Интернет-чат ("аська"): Pidgin, Miranda IM. Почта: Thunderbird. Торрент-клиенты: Transmission-QT и qBittorrent.

И совет: никогда не ставьте сторонние качалки видео и аудио для социальных сетей! Такие инструменты есть в штатных репозиториях плагинов любого из браузеров! Не засоряйте систему хламом!

Офисные программы

Без преувеличения, лучшие свободные офисные пакеты, с успехом заменяющие проприетарный MS Office (недавно один известный российский банк прислал мне счет в свободном формате ods): это популярный LibreOffice, Apache OpenOffice (наконец-то проект ожил, и хорошо шагнул) и облегченные AbiWord  и Gnumeric. Распознавание текста (свободные аналоги проприетарного ABBYY Fine Reader): gImageReader+tesseract-ocr, Capture2Text.

Прочие свободные программы

Вот собственно и весь "джентльменский набор" свободных и бесплатных программ для Windows. Остальное зависит от конкретных задач, например, для 3d-анимации и 3d-моделирования, понадобится Blender. Для верстки журналов и книг - Scribus, для создания музыки - LMMS, для редактирования растровых изображений - GIMP, для редактирования изображений векторных - Inkscape. САПР: FreeCAD, LibreCAD и BRL-CAD. И т.д. и т.п.

Напомню, все эти программы распространяются по свободным лицензиям GPL, BSD и другим, а значит использование их для любых целей, копирование и даже продажа - полностью легальны. Эти лицензии также гарантируют, что та или иная программа никогда не станет проприетарной. Избавьте себя или вашу компанию от преследований правообладателей раз и навсегда.

Без каких собственнических программ точно не обойтись на Windows?

Без двух проприетарных бесплатных программ: Adobe FlashPlayer и Skype. По первой - разработка ее свободных аналогов (Gnash, Lightspark, Swfdec) ведется вяло, думаю, потому что с вводом html5 надобность в ней вообще отпадет. По второй - аналогов (в том числе и свободных) тоже много, но монополиста невозможно убрать точечно, только если сразу и все вдруг удалят Skype и поставят аналоги, - а это утопия.

Ставить эти нехорошие программы следует только с родных сайтов! http://get.adobe.com/ru/flashplayer и 
http://www.skype.com/ru/download-skype/skype-for-computer соответственно. При закачке будьте внимательны - убирайте все галочки мелким шрифтом, Майкрософт и Адоб постоянно навязывают параллельно какие-то посторонние программы и подписки. Кроме того, во время установки обе программы без разрешения, по-хамски, лезут в автозапуск и сервисы - ни той ни другой делать там нечего - блокируйте! Теми же  Registry Alert или Startup Manager, например, о которых говорилось выше.